成熟的免疫细胞从造血干细胞分化而来，而造血干细胞可见于骨髓、外周血和胎盘。这些造血干细胞可分化成共同髓系祖细胞 (CMP) 或共同淋巴祖细胞 (CLP)。CMP 和 CLP 会产生天然和适应性免疫系统的各种细胞组分。
与不同分化阶段的白细胞表面分子的有相似结合模式的抗体群组可用被来检测“分化群”(cluster of differentiation, CD) 抗原。这些 CD 表达模式识别个别的免疫细胞类别，可以用来检测某个异质细胞群中是否存在某种特异性免疫细胞。例如，T 细胞可根据 CD3 表达进行检测，但也可根据是否存在 CD8 进一步细分成细胞毒性 T 细胞，或根据是否存在 CD4 分成 T 辅助性细胞。
免疫组织化学免疫表型分析可以评估某些蛋白的表达和组织结构，这可能无法通过流式细胞术免疫表型分析做到。此外，IHC 的检测结果可提供无法通过流式细胞术获得的关于细胞参与模式和细胞学特征的其他信息。
CST 创建了一个有用的常见免疫细胞表型分析标记物表，附有更多信息和相关产品信息的链接。
小鼠模型是在基因和生物学上与人相似的重要临床前研究工具。但对小鼠组织使用时，小鼠单克隆抗体会有二抗相关背景。兔单克隆抗体是解决这一问题的理想解决方案。CST 提供不断扩大的小鼠反应性兔单克隆抗体系列，这些抗体具有在 IHC 免疫表型分析中获得可靠结果所需的出色特异性、灵敏性和性能。CST 使用同源小鼠模型和正常小鼠组织来确认我们客户正在使用的相同临床前模型中的特异性，从而保持高品质标准。
流式细胞术较 IHC 也有一些优势。尤其是，流式细胞术可以：