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PhosphoScan® 磷酸化蛋白质组学

PTMScan Discovery 工作流程

蛋白激酶可逆添加磷酸基，以激活或抑制蛋白质功能。磷酸化信号级联放大，例如 MAP 激酶信号转导通路，对于从细胞外部传递信息至细胞内部、最终在细胞里进行基因转录调控至关重要。异常磷酸化广泛存在于诸如癌症、糖尿病与神经退行性疾病等疾病中。因此，识别出蛋白质的磷酸化状态，对于了解健康状态和疾病状态下的细胞过程十分关键。

将 PhosphoScan® 蛋白质组学应用于

  • 通路分析
  • 生物标记物发现
  • 靶标验证

为什么在磷酸化蛋白质组学中需要考虑抗体富集？

  • 与 IMAC 相比，更关注于发现基于氨基酸 (S/T/Y) 或目标基序的磷酸化位点。
  • PTMScan® 方法与 IMAC 富集不同的磷酸肽池，使之高度互补。为了获得最完整的数据集，客户应该使用两种富集类型。查看数据。

PTMScan Discovery 点阵

在 MKN-45 细胞中的酪氨酸磷酸化。MKN-45 细胞中的肽，在使用 DMSO（对照）、1 μM SU11274 或 200 nM Staurosporine #9953 处理 2 小时后，使用 PTMScan® Phospho-Tyrosine Rabbit mAb (P-Tyr-1000) Kit #8803（上图）进行富集。同时，通过 LC-MS/MS 检测未经富集的材料，分析总蛋白水平（下图）。经 SU11274 或 Staurosporine 处理而丰度减少的肽用红色表示，经过处理后丰度增加的肽用绿色表示。右侧显示每个富集的分析重复测量次数的 A % CV 直方图，中位值 % CV 用蓝色表示。

PhosphoScan 服务

注：可针对服务定制丝氨酸/苏氨酸基序抗体组合。敬请咨询。

靶标描述 基序 参考数据
靶标描述 基序 参考数据
14-3-3 结合基序 (R/K)XX(s/t)XP  
Akt 底物 RXX(s/t) 小鼠肝脏 | XLS | RAW
Akt 底物 RXRXX(s/t) 小鼠肝脏 | XLS | RAW
AMPK 底物 LXRXX(s/t) 小鼠肝脏 | XLS | RAW
ATM/ATR 底物 (s/t)Q 小鼠肝脏 | XLS | RAW
ATM/ATR 底物 (s/t)QG 小鼠肝脏 | XLS | RAW
CDK 底物 (K/R)(s/t)PX(K/R)  
CK2 底物 (s/t)(D/E)X(D/E)  
MAPK/CDK 底物 PX(s/t)P, (s/t)PX(K/R) 小鼠肝脏 | XLS | RAW
PDK1 对接基序 (F/K)XX(F/Y)(s/t)F/Y) 小鼠肝脏 | XLS | RAW
PKA 底物 (K/R)(K/R)X(s/t) 小鼠肝脏 | XLS | RAW
PKC 底物 (K/R)X(s/t)X(K/R) 小鼠肝脏 | XLS | RAW
PKD 底物 LXRXX(s/t)  
PLK 结合基序 S(s/t)P 小鼠肝脏 | XLS | RAW
tP 基序 (s/t)P, (s/t)PP  
tPE 基序 (s/t)PE 小鼠肝脏 | XLS | RAW
tXR/tPR 基序 (s/t)XR, (S/t)PR 小鼠肝脏 | XLS | RAW
Phospho-Tyrosine (pY-1000) y 小鼠脑 | XLS | RAW
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资源