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靶向蛋白质降解的解决方案

靶向蛋白降解 (TPD) 是一种前瞻性的治疗方法，它利用细胞自身的破坏性机制来降解导致疾病或驱动疾病进展的蛋白质。TPD 作为一种治疗方式颇具吸引力，因为许多目的蛋白 (POI) 缺乏传统小分子疗法可以靶向的特征（例如结合口袋），从而导致它们无法使用常规方法进行治疗。蛋白质降解剂平台（例如蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC) 和分子胶）代表了一类新型药物（“降解剂”），它们利用泛素-蛋白酶体系统 (UPS) 来启动目的蛋白降解，而自噬体束缚化合物 (ATTEC)、自噬靶向嵌合体 (AUTOTAC)、自噬靶向嵌合体 (AUTAC)、基于抗体的 PROTAC (AbTAC) 和溶酶体靶向嵌合体 (LYTAC) 等平台则利用降解剂，使用自噬体或溶酶体系统来降解目的蛋白。这些平台连同其他靶向蛋白降解模式一起可以通过诱导目的蛋白和效应分子之间的邻近相互作用来靶向以前不可成药的蛋白质发生降解，从而为针对多种疾病的靶向药物治疗的潜在开发打开了大门。

Cell Signaling Technology 的科学家拥有深厚的信号转导专业知识，可以帮助您了解靶向蛋白降解治疗候选靶标的靶向和脱靶效应。您还可以访问包含各种产品的广泛目录，以及行业领先的蛋白质组学服务，这可以帮助您简化降解物发现工作流程。

靶向蛋白质降解 (TPD) 产品和服务

单击图表中的每个步骤即可了解有关可用的特定 CST 工作流程解决方案的更多信息。

该图显示了泛素蛋白酶体系统介导的 TPD 药物发现的步骤

泛素蛋白酶体系统介导的 TPD 药物发现。 （步骤 1）筛选可与 E3 连接酶和靶标蛋白结合的降解剂候选物。（步骤 2）确认降解剂与 E3 连接酶和靶标蛋白形成三元复合体。（步骤 3）检查靶标蛋白聚泛素化。（步骤 4）对靶标降解定量。（步骤 5）研究中靶和脱靶效应，以了解被降解靶标蛋白的表型。

降解剂发现

降解剂发现

您可以使用以下产品识别目的细胞或组织中靶标分子的降解物和相关的 E3 泛素连接酶。

  • E3 连接酶抗体：识别 E3 连接酶或其成分（如 CRBN、VHL、KEAP1 和 MDM2）的特异性抗体已经过验证，适用于您的平台。欲知一系列 E3 泛素连接酶及其已知底物，请参阅泛素连接酶表。
  • 蛋白质组学分析服务借助于 CST 蛋白质组学分析服务，剖析关键蛋白质和翻译后修饰，以快速确定潜在靶标和 E3 泛素连接酶。这些服务提供化学性蛋白质组学，以确定复杂蛋白质组中的反应性半胱氨酸，开发共价性抑制剂药物，从而让您揭示新型半胱氨酸，这些半胱氨酸调节蛋白质功能或帮助识别易受亲电弹头影响的细胞靶标。
  • 半胱氨酸剖析：在复杂生物系统的背景下定位目的蛋白上的反应性氨基酸侧链。使用反应性半胱氨酸标记法连同肽富集质谱分析获得优化的工作流程解决方案，以高效确定并且量化重要蛋白质靶标上可接近的反应性半胱氨酸位点。

三元复合体形成

三元复合体形成

您可以使用旨在揭示蛋白质-蛋白质相互作用的分析方法来研究三元复合体的形成。示例包括 TR-FRET、免疫共沉淀或 AlphaLISA，它们使用目标特异性抗体来证明 E3 连接酶与靶标蛋白之间的物理接近性。最佳三元复合体形成对于 POI 的有效泛素化至关重要，并且对于有效的 UPS 介导的降解也是必需的。

CST 提供经过验证且可重复的现成解决方案，包括加标签抗体和匹配抗体对，以支持三元复合体形成实验。没有看到您的平台所需的偶联过程或制剂？CST 可以为您开发、优化和验证它。

  • 定制化偶联服务：CST 拥有高度经验的定制偶联专家，您可以信赖他们。如果您在我们的目录中没有看到您的平台所需的偶联抗体，我们可以为您将抗体与金属、荧光团、生物、DIG 和其他标记偶联。查看与您所使用的分析平台兼容的抗体资源和指南，找到适用的偶联方式。
  • 配对抗体对：不含载体蛋白、随时偶联型配对抗体对已为您作了优化，随时用于您的 TR-FRET 检测。
  • 用于免疫学检测方法开发的定制制剂：订购无 BSA、无叠氮化物和无甘油的抗体制剂，用于开发您的 ELISA 相关检测和体内功能检测。
  • 标签抗体：使用特异、灵敏的 CST® 加标签抗体在免疫共沉淀实验中下拉转染的重组加标签蛋白质。
  • 蛋白质组学分析服务： 定性和定量剖析您样品中的蛋白质。CST 科学家可以实施串联质量标签 (TMT) 测定法评估蛋白质-蛋白质相互作用，并实施邻近标记法 (TurboID/BioID) 为您确认三元复合体形成。

靶标泛素化

靶标泛素化

您可使用 CST 蛋白质稳态抗体确认靶标蛋白的泛素化，或使用 PTMScan® 泛素试剂盒或利用 CST 蛋白质组分析服务获得靶标蛋白上所有泛素化位点的全面视图。

靶标降解

靶标降解

您可以使用 CST 提供的特异和灵敏的抗体直接测定治疗后靶标蛋白的水平，从而评估降解剂候选物的有效性。

经应用验证的抗体，包括但不限于：

 

您可以找到针对您的目的靶标的高质量抗体，这些抗体已经过验证并批准用于以下应用：

此外，现成或定制的无载体蛋白抗体可用于高通量基于双抗夹心法的检测平台。您的平台需要专用抗体偶联吗？CST 也可提供定制偶联服务。

如果您的靶标是某蛋白质如 EGFR 的突变形式，请搜索 CST 的突变体特异性抗体目录。没有看到您正在寻找的蛋白质突变？联系我们以了解更多信息！

中靶/脱靶效应

中靶/脱靶效应

利用 CST 蛋白质组学分析服务，在分子层面广泛理解 TPD 分子脱靶效应。

与 CST 科学家合作，执行以下操作：

  • 蛋白质组学发现服务：
    • PTMScan 发现蛋白质组学服务： 根据您的目的靶标，对样品中的泛素化、磷酸化、乙酰化和甲基化蛋白质进行全面 PTM 分析，以监测 TPD 分子的下游影响。
    • KinomeView® 服务：在靶向激酶时确定在 TPD 分子治疗中受调节的激酶组区域。
  • 总蛋白质组分析：
    • 通过时程研究深入了解 TPD 分子的下游效应并确定效力。
    • 了解 TPD 分子的中靶特异性和脱靶交叉反应性。
  • UbiScan — 泛素化蛋白质组：使用 LC-MS/MS 定量分析数千个非冗余泛素化序列，以识别那些被不利靶向导致蛋白酶体降解的脱靶蛋白质。

或使用以下 CST 试剂盒之一：

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