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WD40 蛋白结构域

磷酸化丝氨酸/苏氨酸和甲基化赖氨酸:WD40 结构域

结合周期素 E CPD 磷酸肽的 Cdc4 的 WD40 结构域。

结构域结合和功能

WD40 重复序列是一种最富集的可检测的蛋白结构域,见于各种各样的真核细胞蛋白,这些蛋白可能会在信号转导、前体 mRNA 加工、细胞骨架组装、转录激活和细胞周期调控中发挥接头蛋白/调节分子作用。含 WD40 结构域的蛋白的一个共同特征是重复序列能够形成 β 螺旋桨结构,这个结构可作为稳定或可逆地结合结合伴侣的平台。WD 重复序列的明确特征包括保守的色氨酸 (W) 和天冬氨酸 (D) 残基,以及一个长约 40 个氨基酸的重复序列。WD40 重复序列结构域螺旋桨结构是一个通用模块,可参与检测翻译后修饰。β-TRCP 和 Cdc4 的 WD40 重复序列结构域可检测含磷酸化丝氨酸和苏氨酸的肽。相比之下,WDR5 的 WD40 重复序列结构域可检测组蛋白 H3 氨基末端尾区中的去甲基化赖氨酸肽。

结构

Cdc4 的 WD40 重复序列区域显示出八个 WD40 重复序列区域,这些区域会形成一个八叶片的 β 螺旋桨结构。多数带有所述结构的 WD40 蛋白显示出一个七叶片的 β 螺旋桨结构。WD40 结构域被发现是一个圆锥形截头体,含有一个 40 Å 直径的顶部表面、一个 50 Å 的底部表面、一个 30 Å 的总厚度、以及一个 6 Å 直径的中央核心。WD40 结构域可使用截头体顶部表面来检测 Cdc4 磷酸化降解子 (CPD) 肽。

结构参考

  1. Orlicky S., et al. (2003) Cell 112(2) 243–256.

结构域蛋白示例

磷酸化丝氨酸/苏氨酸和甲基化赖氨酸:WD40 结构域

结合示例

含 WD40 的蛋白 靶蛋白 共有序列
βTRCP/Fbw1 β-catenin、IκB D-pS-G-φ-X-pS
Cdc4/Fbw7 Cyclin E, Sic1p, Gcn4p L-I/L/P-pT-P
WDR5 组蛋白 H3 R-X-Kdimethyl