酵母 Cue2 蛋白 - 泛素的 CUE 结构域（红色）。
CUE 结构域最初被发现是酵母 Cue1（结合泛素会诱导 ER 降解）和人 Tollip 蛋白之间的一个同源结构域。结构域长约 40 个氨基酸，可见于有各种功能的蛋白，功能包括在内质网和蛋白分选中错误折叠蛋白的降解。CUE 结构域经证实可结合单泛素和聚泛素，某些包含 CUE 结构域的蛋白会自行以依赖于 CUE 结构域的方式进行泛素化。
CUE 结构域在结构上与泛素结合的 UBA 结构域有关，并包含一个三螺旋束。α-螺旋 1 中的一个保守 MFP 基序以及 α-螺旋 3 中的一个 LL 基序会与保守的泛素疏水片相互作用。报道称，CUE 结构域还以结构域交换二聚体的形式存在，可另外接触泛素，从而以更高的亲和力结合泛素。
| CUE 结构域伴侣 | 结合伴侣 |
| Vps9 | 单泛素和聚泛素 |
| Cue1 | 单泛素和聚泛素 |
| Tollip | 单泛素（未检测聚泛素） |