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SOCS 蛋白结构域

蛋白降解:SOCS 结构域

VHLVHLα 结构域。

结构域结合和功能

SOCS 盒是一个约有 40 个氨基酸的同源区域,最初在细胞因子信号转导抑制因子 (SOCS) 蛋白家族的成员中被确定。SOCS 盒始终位于羧基末端,并且似乎有助于靶向蛋白的泛素化。BC 盒是一个对 SOCS 盒和 VHLα 结构域均较为常见的亚结构域,可促进结合延伸蛋白 BC 复合体。延伸蛋白 BC 复合体还与 von-Hippel Lindau (VHL) 抑癌基因蛋白相互作用,从而形成一个更大的 VCB E3 泛素蛋白连接酶复合体的核心。在这个背景下,SOCS 盒/VHLα 结构域可能与结构相关的 F 盒蛋白类似,F 盒蛋白会在泛素化期间将底物连接至 E3 复合体。有五种不同类型的氨基末端区域与羧基末端 SOCS 盒有关。这些包括 SH2 结构域(SOCS 蛋白)、WD40 重复序列(WSB 蛋白)、SPRY 结构域(SSB 蛋白)、锚蛋白重复序列(ASB 蛋白)和 GTP 酶结构域(RAR 家族)。

结构

SOCS/VHLα 结构域含有三个按形似所谓的“折叠叶”簇的方式堆放的 α-螺旋,缺失的四个 α-螺旋中的一个除外。延伸蛋白 C 的一个螺旋可填充这个空缺,从而构成四螺旋簇,并形成两对螺旋以彼此垂直的方式堆叠的排列。

结构参考

  1. Stebbins, C.E. et al. (1999) Science 284(5413), 455–461.

结构域蛋白示例

蛋白降解:SOCS 结构域

结合示例

SOCS 结构域蛋白 结合伴侣
Socs-1 Elongin B/C
Socs-3 Elongin B/C